Nagisa ist die zweite Insel, die von den Freien nach ihrem Schiffbruch mit ihrem neuen Schiff MS Elysia angefahren wurde. Dort gab es zunächst ein Fest für die Krönung der neuen Kaiserin. Danach wurden die Freien von der neuen Kaiserin, Kiyomi II. von Nagisa, beauftragt, einen Verräter in ihren eigenen Reihen zu finden. Diesen fanden sie nach einigen Tagen in Emika Helios, der Hohepriesterin am Hode, die von einer dunklen Macht eingenommen war.

Bekannter Bewohner von Nagisa sind: Kiyomi II., Taketo Erai, Desdemona Zelos, Yui Estalor, Emika Helios, Zoronar Kuna.